Den andra säsongen av Morden i Sandhamn är baserad på Viveca Stens kriminalroman I den innersta kretsen. Precis efter målgången i Gotland runt på Sandhamn blir kaptenen på vinnarbåten skjuten. Kriminalinspektör Thomas Andreasson får i uppdrag, att tillsammans med sin kollega Mia Holmgren, undersöka mordet. Nora Linde hjälper till med utredningen av fallet.